학교소개

연구 성과

 


 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

연구 성과 게시글의 상세 화면
제목 [논문] 하상준 교수님_Single-cell transcriptome analysis revealed TOX as a transcription factor promoting CD8+ T cell ...
작성자 비임파성 장기 면역 연구센터 등록일 2021-01-26 조회수 749
Single-cell transcriptome analysis revealed TOX as a transcription factor promoting CD8+ T cell exhaustion in cancer

- Background: T cells exhibit heterogeneous functional states in the tumor microenvironment. Immune checkpoint inhibitors (ICIs) can reinvigorate only the stem cell-like progenitor exhausted T cells, which suggests that inhibiting the exhaustion progress will improve the efficacy of immunotherapy. Thus, regulatory factors promoting T cell exhaustion could serve as potential targets for delaying the process and improving ICI efficacy.
- Methods: We analyzed the single-cell transcriptome data derived from human melanoma and non-small cell lung cancer (NSCLC) samples and classified the tumor-infiltrating (TI) CD8+ T cell population based on PDCD1 (PD-1) levels, i.e., PDCD1-high and PDCD1-low cells. Additionally, we identified differentially expressed genes as candidate factors regulating intra-tumoral T cell exhaustion. The co-expression of candidate genes with immune checkpoint (IC) molecules in the TI CD8+ T cells was confirmed by single-cell trajectory and flow cytometry analyses. The lossof- function effect of the candidate regulator was examined by a cell-based knockdown assay. The clinical effect of the candidate regulator was evaluated based on the overall survival and anti-PD-1 responses. 
- Results: We retrieved many known factors for regulating T cell exhaustion among the differentially expressed genes between PDCD1-high and PDCD1-low subsets of the TI CD8+ T cells in human melanoma and NSCLC. TOX was the only transcription factor (TF) predicted in both tumor types. TOX levels tend to increase as CD8+ T cells become more exhausted. Flow cytometry analysis revealed a correlation between TOX expression and severity of intra-tumoral T cell exhaustion. TOX knockdown in the human TI CD8+ T cells resulted in downregulation of PD-1, TIM-3, TIGIT, and CTLA-4, which suggests that TOX promotes intra-tumoral T cell exhaustion by upregulating IC proteins in cancer. Finally, the TOX level in the TI T cells was found to be highly predictive of overall survival and anti-PD-1 efficacy in melanoma and NSCLC. 
연구 성과 게시판의 이전글 다음글
이전글 [논문] 김혜영 교수님_Reduction of circulating innate lymphoid cell progenitors results in impaired cytokine production by...
다음글 [논문] 하상준 교수님_Re-defining T-cell exhaustion: subset, function, and regulation
목록